Средняя школа № 13 была образована в 1951 году на базе начальной школы №13 и 5-6 классов средней школы №27
Учредителем Учреждения и собственником его имущества является муниципальное образование «Город Курск».
Функции и полномочия учредителя Учреждения от имени муниципального образования «Город Курск» осуществляет комитет образования города Курска, в ведении которого Учреждение находится.